Imperfecto de Subjuntivo используется во временном значении одновременности или следования в придаточном предложении, когда глагол в главном предложении стоит в одном из прошедших времен (только не забывайте, что compuesto - he estado, has estado etc. не входит в группу прошедших времен, оно входит в группу настоящих времен), например:
Me alegraba de que me comprendieran - я радовался, что они меня понимают (одновременность)
QuerIa que me comprendieran - я хотел, чтобы они меня поняли (следование)
Реже Imperfecto используется вместо Perfecto (см.следующий пост)